| Title: | 基因组重组问题的一个更快算法 |
| Alternative Title: | a faster algorithm for genomic sorting problem
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| Author: | 亓兴勤
; 李国君
; 李曙光
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| Keyword: | 翻转
; 移位
; 重组序列
; 基因组
; Reversal
; Translocation
; Genomic sorting
; 基因组
; 重组
; 算法复杂性
; genomic sequence
; genomic sorting
; sequence of
; 目标
; 联接
; 转化
; 移位
; 标号
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| Source: | 应用数学
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| Issued Date: | 2006
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| Volume: | 19, Issue:1, Pages:66-74 | | Indexed Type: | wanfang
; cnki
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| Department: | 山东大学数学与系统科学学院,山东,济南,250100;山东大学数学与系统科学学院,山东,济南,250100;中国科学院软件所,北京,100080;山东大学数学与系统科学学院,山东,济南,250100;烟台大学数学与信息科学系,山东,烟台,264005
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| Abstract: | 寻找一个基因组(源基因组)转化成另一个基因组(目标基因组)所需最少数目移位和翻转的问题,称为基因组重组问题.此问题的"瓶颈"在于寻找源基因组的一个最优"联接";若源基因组和目标基因组是"共尾"的,Hannenhalli和Pevzner给出一个O(n2)算法得到源基因组的一个最优"联接",本文将此算法复杂性将低到O(n),其中n为基因组中所含基因的个数.从而由Eric.T和Marie-France的结果得到求"共尾"标号基因组间重组序列的一个O(n √nlogn)算法. |
| Language: | 中文
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| Content Type: | 期刊论文
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| URI: | http://ir.iscas.ac.cn/handle/311060/11672
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| Appears in Collections: | 软件所图书馆_期刊论文
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| Recommended Citation: | |
亓兴勤,李国君,李曙光. 基因组重组问题的一个更快算法[J]. 应用数学,2006-01-01,19(1):66-74.
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