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题名:
最大节约原则下单倍型推导问题的实用算法
作者: 张强锋 ; 车皓阳 ; 陈国良 ; 孙广中
关键词: 基因型,单倍型,SNP,单倍型推导,最大节约原则,贪心算法Algorithms ; Artificial intelligence ; Data processing ; Genes
刊名: 软件学报
发表日期: 2005
卷: 16, 期:10, 页:1699-1707
收录类别: cnki ; ei
部门归属: 中国科学技术大学计算机科学技术系,中国科学院软件研究所,中国科学技术大学计算机科学技术系,中国科学技术大学计算机科学技术系 安徽 合肥 230027,北京 100080,安徽 合肥 230027,安徽 合肥 230027
摘要: 在疾病的易感基因研究和药物反应实验中,常常需要知道单倍型,而不仅仅是基因型数据.但是直接通过生物学实验手段来测定单倍型在时间和成本上消耗过大,所以在实验室里往往仅测得基因型,而通过一些计算手段来推导出单倍型.不同于Clark著名的单倍型推导模型,Gusfield和Wang等人提出了一种通过基因型样本推导单倍型的新模型.这种模型试图按照最大节约原则去寻找可以解释基因型样本的最小单倍型集合.这种基于节约原则的模型克服了Clark模型的一些缺陷.提出了节约原则模型的一个多项式时间的贪心算法以及一种把贪心策略和分
语种: 英语
内容类型: 期刊论文
URI标识: http://ir.iscas.ac.cn/handle/311060/12394
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张强锋,车皓阳,陈国良,等. 最大节约原则下单倍型推导问题的实用算法[J]. 软件学报,2005-01-01,16(10):1699-1707.
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