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题名:
P-QuantWiz:一种基于质谱的并行非标记定量软件
其他题名: P-QuantWiz:一种基于质谱的并行非标记定量软件
作者: 胡泽林 ; 张云泉 ; 王靖 ; 张先轶
关键词: 质谱 ; 非标记定量 ; 色谱峰 ; 保留时间 ; 并行化 mass spectrometry ; label-free quantification ; chromatographic peaks ; retention time ; parallelization
刊名: 计算机工程与科学
发表日期: 2009
卷: 31, 期:11, 页:124-127
收录类别: cnki,wanfang,cscd
部门归属: 并行计算实验室
摘要: 本文设计并实现了基于质谱的非标记定量软件QuantWiz,通过改变肽段定量的顺序,提高了定量软件的时间局部性和质谱数据缓存的命中次数。分析了QuantWiz的多种数据并行策略,设计并实现了按保留时间划分的并行定量软件P-QuantWiz。通过实验验证P-QuantWiz具有良好的并行效率,当进程数为32时,并行效率为63%。
语种: 中文
内容类型: 期刊论文
URI标识: http://ir.iscas.ac.cn/handle/311060/4280
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胡泽林,张云泉,王靖,等. P-QuantWiz:一种基于质谱的并行非标记定量软件[J]. 计算机工程与科学,2009-01-01,31(11):124-127.
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