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基因组重组问题的一个更快算法
其他题名a faster algorithm for genomic sorting problem
亓兴勤; 李国君; 李曙光
2006
发表期刊应用数学
ISSN1001-9847
卷号19期号:1页码:66-74
摘要寻找一个基因组(源基因组)转化成另一个基因组(目标基因组)所需最少数目移位和翻转的问题,称为基因组重组问题.此问题的"瓶颈"在于寻找源基因组的一个最优"联接";若源基因组和目标基因组是"共尾"的,Hannenhalli和Pevzner给出一个O(n2)算法得到源基因组的一个最优"联接",本文将此算法复杂性将低到O(n),其中n为基因组中所含基因的个数.从而由Eric.T和Marie-France的结果得到求"共尾"标号基因组间重组序列的一个O(n √nlogn)算法.
收录类别wanfang ; cnki
关键词翻转 移位 重组序列 基因组 Reversal Translocation Genomic Sorting 基因组 重组 算法复杂性 Genomic Sequence Genomic Sorting Sequence Of 目标 联接 转化 移位 标号
部门归属山东大学数学与系统科学学院,山东,济南,250100;山东大学数学与系统科学学院,山东,济南,250100;中国科学院软件所,北京,100080;山东大学数学与系统科学学院,山东,济南,250100;烟台大学数学与信息科学系,山东,烟台,264005
语种中文
内容类型期刊论文
URI标识http://ir.iscas.ac.cn/handle/311060/11672
专题中国科学院软件研究所
推荐引用方式
GB/T 7714
亓兴勤,李国君,李曙光. 基因组重组问题的一个更快算法[J]. 应用数学,2006,19(1):66-74.
APA 亓兴勤,李国君,&李曙光.(2006).基因组重组问题的一个更快算法.应用数学,19(1),66-74.
MLA 亓兴勤,et al."基因组重组问题的一个更快算法".应用数学 19.1(2006):66-74.
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