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| 基于Pthreads的并行DSRC压缩算法设计与实现 | |
| 詹科; 张云泉; 王婷; 郑晶晶; 张鹏 | |
| 2013 | |
| Conference Name | 2013全国高性能计算学术年会 |
| Pages | 782-786 |
| Conference Date | 2013 |
| Conference Place | 桂林 |
| Department | 中国科学院软件研究所,并行软件与计算科学实验室,北京,100190 中国科学院软件研究所,并行软件与计算科学实验室,北京,100190;中国科学院计算技术研究所,计算机体系结构国家重点实验室,北京,100190 中国科学院计算技术研究所,计算机体系结构国家重点实验室,北京,100190;广州中国科学院软件应用技术研究所,广州,511458 |
| English Abstract | 高通量测序仪产生大量的DNA 数据,FASTQ 是存储DNA 数据被广泛使用的数据格式.对FASTQ 格式的数据进行压缩处理,能有效的节省存储空间.DSRC 算法具有压缩比高的优点,因此对DSRC 算法进行并行,能提高压缩FASTQ 格式的DNA 数据的效率.本文基于Pthreads,并行了DSRC 算法,测试结果表明,当使用4线程,加速比达到3.5. |
| Keyword | Fastq 数据压缩 Dsrc Pthreads |
| Language | 中文 |
| Content Type | 会议论文 |
| URI | http://ir.iscas.ac.cn/handle/311060/16564 |
| Collection | 中国科学院软件研究所 |
| Recommended Citation GB/T 7714 | 詹科,张云泉,王婷,等. 基于Pthreads的并行DSRC压缩算法设计与实现[C],2013:782-786. |
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