| 基于Pthreads的并行DSRC压缩算法设计与实现 |
| 詹科; 张云泉; 王婷; 郑晶晶; 张鹏
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| 2013
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| 会议名称 | 2013全国高性能计算学术年会
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| 页码 | 782-786
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| 会议日期 | 2013
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| 会议地点 | 桂林
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| 部门归属 | 中国科学院软件研究所,并行软件与计算科学实验室,北京,100190 中国科学院软件研究所,并行软件与计算科学实验室,北京,100190;中国科学院计算技术研究所,计算机体系结构国家重点实验室,北京,100190 中国科学院计算技术研究所,计算机体系结构国家重点实验室,北京,100190;广州中国科学院软件应用技术研究所,广州,511458
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| 摘要 | 高通量测序仪产生大量的DNA 数据,FASTQ 是存储DNA 数据被广泛使用的数据格式.对FASTQ 格式的数据进行压缩处理,能有效的节省存储空间.DSRC 算法具有压缩比高的优点,因此对DSRC 算法进行并行,能提高压缩FASTQ 格式的DNA 数据的效率.本文基于Pthreads,并行了DSRC 算法,测试结果表明,当使用4线程,加速比达到3.5. |
| 关键词 | Fastq
数据压缩
Dsrc
Pthreads
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| 语种 | 中文
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| 内容类型 | 会议论文
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| URI标识 | http://ir.iscas.ac.cn/handle/311060/16564
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| 专题 | 中国科学院软件研究所
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推荐引用方式
GB/T 7714 |
詹科,张云泉,王婷,等. 基于Pthreads的并行DSRC压缩算法设计与实现[C],2013:782-786.
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